Międzynarodowy doktorat z biologii strukturalnej

Międzynarodowy doktorat z biologii strukturalnej to międzynarodowy doktorat powstały we współpracy z uniwersytetami we Frankfurcie i Utrechcie. Powstał na mocy porozumienia podpisanego przez trzech Rektorów w 2001 roku. Na podstawie tego porozumienia tytuł doktora uzyskany przez studentów na zakończenie programu uważa się za równoważny z tytułem uzyskanym w Centrum Badań Biomolekularnych Bijvoet oraz stopniem doktora doktorat z chemii i biochemii na Uniwersytecie we Frankfurcie.

Studia doktoranckie mają na celu kształcenie doktorantów będących w czołówce wiedzy i edukacji w zakresie nowoczesnych metod badawczych w biologii strukturalnej, biotechnologii i biologii systemów. Zapewnia bogatą wiedzę do szkolenia ekspertów w dziedzinie chemii strukturalnej stosowanej do makrocząsteczek biologicznych w roztworze, we fibrylach, w błonach lub komórkach oraz w dziedzinie biologii molekularnej do ekspresji izotopowo wzbogaconych rekombinowanych białek.

Instytucja goszcząca

Centrum Rezonansu Magnetycznego (CERM) University of Florence to infrastruktura badawcza wspierana przez Komisję Europejską w celu zapewniania ponadnarodowego dostępu do biologicznego NMR. CERM jest jednym z pierwszych laboratoriów na świecie pod względem jakości sprzętu, produkcji i wiarygodności naukowej w zakresie biologii strukturalnej i NMR. Infrastruktura jest wyjątkowo wyposażona w dużą liczbę spektrometrów NMR w zakresie od 1200 MHz do 0,01 MHz, poprzez spektrometry 950, 900, 850 WB, 800, 700, 600, 500 i 400 MHz. Wiele z tych instrumentów jest wyposażonych w kriosondę. Ma wyspecjalizowaną tradycję w badaniu metaloprotein, zwłaszcza metaloprotein paramagnetycznych. CERM jest głównym członkiem INSTRUCT, europejskiej infrastruktury zintegrowanej biologii strukturalnej, która obejmuje centra najnowocześniejszych technologii, wiedzy naukowej i szkoleń.

Studenci kształcą się w zakresie styku biologii i chemii nieorganicznej poprzez bioinformatykę i spektroskopię. Długoterminowym celem edukacyjnym jest wykształcenie naukowców zdolnych do ujęcia konkretnych problemów w ogólnym kontekście, uznania wielodyscyplinarności za podstawową potrzebę i uznania współpracy transnarodowej za wymóg rozwoju spójnego pokolenia europejskich naukowców.

Przedmioty stanowiące podstawę kursu to:

• Jądrowy rezonans magnetyczny (w roztworze iw stanie stałym) oraz krystalografia rentgenowska do badań strukturalnych, funkcji i dynamiki makrocząsteczek biologicznych, oddziaływań białko-białko;
• Techniki biologii molekularnej i biologii komórkowej do przygotowania i manipulacji białkami, DNA i konsorcjami bakteryjnymi;
• opracowywanie nowych leków poprzez techniki projektowania leków;
• Bioinformatyka jako podstawowa strategia badania zjawisk kinetycznych, termodynamicznych i dynamiki białek, uczenia się i opracowywania metod wykorzystania genomowych baz danych w celu identyfikacji celów molekularnych do opracowywania nowych leków;
• metabolomika.

Program doktorancki opiera się na współpracy grup badawczych z uniwersytetów w Utrechcie, Frankfurcie, Lyonie i Oksfordzie, jednych z najważniejszych na świecie w dziedzinie biologii strukturalnej.

Celem kursu jest zapewnienie wysokiej jakości, multidyscyplinarnego szkolenia badawczego w dziedzinie biologii strukturalnej. Aby to osiągnąć, kurs obejmuje bardzo szeroki zintegrowany program, który obejmuje wiedzę specjalistyczną z chemii, biologii, biofizyki, medycyny i informatyki, zdolny sprostać rzeczywistym wyzwaniom w tej dziedzinie, od zagadnień podstawowych po zastosowania. Nowe pokolenie doktorantów będzie kształcone tak, aby uznawać badania multidyscyplinarne, współpracę transnarodową i integrację różnych technik za podstawowe potrzeby rozwoju doskonałych badań.

Biologia strukturalna jest kluczem do innowacji w biotechnologii, technologii żywności i zastosowaniach biomedycznych. Odgrywa główną rolę w zrozumieniu sposobu działania środków terapeutycznych i ułatwia projektowanie innowacyjnych leków i leków biologicznych działających na określone cele molekularne. Począwszy od określenia trójwymiarowych struktur makrocząsteczek, biologia strukturalna ewoluowała w kierunku badania dynamiki makrocząsteczek i mechanizmów makromolekularnych oraz umieszczania ich w kontekstach komórkowych. Zapewnia wizualizację biomolekuł i sposobu ich funkcjonowania na poziomie atomowym. Firmy farmaceutyczne posiadają działy biologii strukturalnej zaangażowane w różne etapy procesu odkrywania leków. W rzeczywistości obszary takie jak świadome leki i nowe szczepionki często w decydującym stopniu zależą od danych strukturalnych.

Oczekuje się, że w przyszłości coraz większe układy molekularne i coraz bardziej złożone zjawiska biologiczne zostaną odkryte dzięki zintegrowanemu podejściu do biologii strukturalnej, łączącemu uzupełniające się narzędzia eksperymentalne i obliczeniowe.

Kandydaci zostaną w tym celu przeszkoleni

• zdobyć solidne wspólne doświadczenie naukowe w obszarze biologii strukturalnej,
• otrzymają zaawansowane i ukierunkowane szkolenie oparte na infrastrukturze w zakresie metodologii badań
• Uczestniczyć i promować swoje badania na konferencjach międzynarodowych
• publikować wyniki swojej pracy w publikacjach międzynarodowych
• poszerzać swoje horyzonty poprzez szeroką gamę kursów i seminariów
• stymulować współpracę interdyscyplinarną
• stymulować mobilność i współpracę transnarodową
• Zdobądź szkolenia niezwiązane z nauką, aby zwiększyć perspektywy kariery
• rozwijać się jako wykwalifikowani, otwarci i niezależni młodzi badacze.